Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms