Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC19Q6DKK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms