Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E4F1Q66K89 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms