Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms