Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms