Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RSPH4AQ5TD94 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
RSPH4AQ5TD94 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms