Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms