Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms