Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CEP170Q5SW79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CEP170Q5SW79 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms