Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms