Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms