Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBL2Q562R1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTBL2Q562R1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms