Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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