Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms