Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UVSSAQ2YD98 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms