Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNOP1Q1ED39 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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