Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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NFIL3Q16649 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIL3Q16649 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIL3Q16649 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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