Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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