Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMCHL1Q16048 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms