Protein–RNA interactions for Protein: Q15669

RHOH, Rho-related GTP-binding protein RhoH, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOHQ15669 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RHOHQ15669 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOHQ15669 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms