Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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NCF4Q15080 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NCF4Q15080 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NCF4Q15080 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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NCF4Q15080 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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NCF4Q15080 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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NCF4Q15080 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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NCF4Q15080 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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NCF4Q15080 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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