Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAPTM4AQ15012 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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