Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK13Q14004 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK13Q14004 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
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