Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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