Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1SQ13698 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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