Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 PRC1-211ENST00000556982 583 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-12■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.462e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.22e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.132e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 PHF23-207ENST00000573826 685 ntTSL 319.09■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 518.94■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 PHF23-206ENST00000572789 1006 ntTSL 218.12■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.194e-10■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.015e-14■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 38.65□□□□□ -1.022e-7■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 KLHDC4-220ENST00000568338 584 ntTSL 48.11□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-10■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 COBLL1-204ENST00000409184 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.01□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.164e-9■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 COBLL1-221ENST00000493868 6332 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.172e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 CIZ1-212ENST00000471773 717 ntTSL 27.62□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 COBLL1-214ENST00000460238 580 ntTSL 27.52□□□□□ -1.212e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-10■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.274e-9■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.272e-10■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 STMN1-208ENST00000485226 449 ntTSL 26.69□□□□□ -1.341e-15■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 TPR-208ENST00000492973 453 ntTSL 26.52□□□□□ -1.378e-12■■■□□ 15.9
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TRA2AQ13595 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 55.92□□□□□ -1.462e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 45.73□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 FMNL2-204ENST00000497192 595 ntTSL 45.68□□□□□ -1.54e-9■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.522e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 15.9
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