Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMK2BQ13554 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK2BQ13554 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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