Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA1Q13330 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms