Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME3Q13232 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME3Q13232 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME3Q13232 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME3Q13232 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME3Q13232 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME3Q13232 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME3Q13232 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME3Q13232 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME3Q13232 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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