Protein–RNA interactions for Protein: Q13190

STX5, Syntaxin-5, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX5Q13190 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX5Q13190 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX5Q13190 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX5Q13190 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX5Q13190 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX5Q13190 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX5Q13190 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX5Q13190 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX5Q13190 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX5Q13190 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STX5Q13190 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX5Q13190 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX5Q13190 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms