Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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BNIP1Q12981 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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BNIP1Q12981 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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BNIP1Q12981 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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BNIP1Q12981 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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BNIP1Q12981 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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BNIP1Q12981 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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