Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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