Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX9Q08211 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms