Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms