Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK18Q07002 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms