Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms