Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL4A3Q01955 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3Q01955 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms