Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MC1RQ01726 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms