Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNB1P98172 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms