Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUCB2P80303 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms