Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HBBP68871 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HBBP68871 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HBBP68871 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HBBP68871 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HBBP68871 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HBBP68871 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HBBP68871 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBBP68871 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBBP68871 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms