Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPNP63162 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPNP63162 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPNP63162 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms