Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP107P57740 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP107P57740 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP107P57740 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUP107P57740 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP107P57740 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP107P57740 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms