Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BACE1P56817 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE1P56817 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE1P56817 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BACE1P56817 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BACE1P56817 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BACE1P56817 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BACE1P56817 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BACE1P56817 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE1P56817 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE1P56817 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE1P56817 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BACE1P56817 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BACE1P56817 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BACE1P56817 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BACE1P56817 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BACE1P56817 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BACE1P56817 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BACE1P56817 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BACE1P56817 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms