Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ELLP55199 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ELLP55199 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ELLP55199 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ELLP55199 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ELLP55199 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ELLP55199 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELLP55199 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELLP55199 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms