Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRLP54845 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRLP54845 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRLP54845 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NRLP54845 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRLP54845 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRLP54845 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRLP54845 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRLP54845 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRLP54845 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms