Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP12AP54707 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms