Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA8P53708 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms