Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms