Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms